09 テロ最終章!!神が与えし教祖の死､そして最後の月曜へ

学校に潜んでいたテロリストとの格闘の末､藤丸(三浦春馬)たちは､ついに抗ウイルス剤を手に入れる｡しかし発症の早かった英(久野雅弘)は､それを接種する事ができずに息絶えてしまう｡藤丸は､英を死なせてしまったのは全部自分のせいだと､悲しみに打ちひしがれ失意のどん底に･･･｡一方､拘置所を襲撃し教祖･神島(嶋田久作)の奪還に成功した｢J｣(成宮寛貴)らテロ集団は､最凶最悪のウイルステロ計画｢ブラッディ･マンデイ｣を実行に移すべく動き出す｡友の死を乗り越え､戦う意を決した藤丸は｢THIRD-i(サード･アイ)｣と協力してテロリストへと立ち向かっていく｡”最後の月曜日”､藤丸は仲間を､東京を､地球を救うことができるのか｡そしてまた1つ､｢J｣によって明かされた真実が､藤丸を追いつめていく･･･｡